Martini粗粒化力场使用手册:2 常见问题

类别:    标签: gmx martini   阅读次数:   版权: (CC) BY-NC-SA

一般性问题

原文更新于 Wednesday, 26 March 2014 12:54

发布于 2016-08-31 15:27:03 翻译: 范新宇; 校对: 李继存

输入参数

原文更新于 Friday, 19 August 2016 13:11

发布于 2016-08-31 15:27:16 翻译: 祝小华; 校对: 李继存

这里, $\a$ 表示LJ项($\a$=6,12)或库伦项($\a$=1)各自的阶数. 在 $r_\text{shift}$ 和截断距离 $r_\text{cut}$ 之间, 势能和力都连续平滑地衰减至0. Martini力场参数化时使用的 $r_\text{shift}$ 为0.9(对LJ)或者0(对库伦), $r_\text{cut}$ 为1.2 nm.

拓扑问题

原文更新于 Friday, 19 August 2016 13:12

发布于 2016-09-27 10:59:41 翻译: 郝阳; 校对: 李继存

模拟问题

原文更新于 Wednesday, 26 March 2014 13:14

发布于 2016-08-31 15:27:25 翻译: 郝阳; 校对: 李继存

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