使用xpm2all脚本计算蛋白二级结构演化及含量

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2020-07-10 10:48:47

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确保系统可以在命令行中使用bash. 我使用的是<code>msys64</code>. 下载最新脚本<a href="https://jerkwin.github.io/gmxtools/">xpm2all.bsh</a>, 测试文件<a href="https://jerkwin.github.io/gmxtools/">ss.xpm</a> 执行<code>bash xpm2all.bsh</code>, 应当输出使用说明执行<code>bash xpm2all.bsh ss.xpm -gpl 1 100</code>, 计算残基1到100的相关数据, 得到二级结构演化数据<code>ss~.gpl</code>, 二级结构含量数据<code>ss~count.xvg</code> 使用<code>gnuplot</code>运行<code>ss~.gpl</code>, 得到二级结构演化图使用<code>gnuplot</code>绘制<code>ss~count.xvg</code>, 得到二级结构含量图图例等还不够完美, 你自己修正修正吧.

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