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3d³
2014-08-15 基于Three的JS动画
2014-08-15 3DPDF文件
2013-04-18 利用PyMOL制作反应势能面示意动画
ahk¹⁰
2019-01-31 谷歌的改版
2018-11-15 计算机辅助翻译软件OmegaT
2018-04-21 自动下载喜马拉雅音频文件
2017-02-25 pdf文件标签管理工具Taggie
2017-02-11 自动调整VMD窗口的位置和大小
2016-09-21 自动更新谷歌host文件的简单程序
2015-03-09 网络在线文档的下载
2014-12-16 动态网页数据的简单获取方法
2014-10-07 Taggie：基于标签的桌面搜索工具
2014-08-06 用于保存电子书籍的简单脚本
amber³⁰
2022-09-24 GROMACS使用amber19sb力场
2019-07-14 许楠：使用GAFF力场参数化小分子的自动化工具
2018-10-14 AMBER 2015伦敦研讨会 - 组合聚类分析示例
2018-06-28 AMBER高级教程A15：室温离子液体
2018-06-24 AMBER高级教程A8：HIV-1整合酶核心结构域的环区动力学
2018-06-07 构建纤维素(多糖)及其衍生物的GLYCAM力场拓扑文件
2018-05-16 AMBER基础教程B3：案例研究--稳定蛋白折叠色氨酸肽笼的全原子结构预测和折叠模拟
2018-04-26 AMBER高级教程A17：伞形采样实例--计算丙氨酸二肽Phi/Psi旋转过程的平均力势PMF
2018-04-19 Amber教程：涉及非标准残基的模拟
2018-04-18 AMBER高级教程A12：使用Amber11处理聚脯氨酸
2018-04-04 AMBER教程C3：CPPTRAJ中的主成分分析
2018-04-03 AMBER高级教程A2：耦合势的QM/MM(量子力学/分子动力学)模拟
2018-03-26 AMBER高级教程A24：使用FEW(Free Energy Workflow)工具计算自由能
2018-03-20 AMBER高级教程A1：建小分子与DNA体系(包括基本电荷计算)
2018-03-15 AMBER CPPTRAJ教程C1：RMSD分析
2018-02-06 AMBER高级教程A16：Amber脂分子教程：Lipid14力场版本
2018-01-31 AMBER高级教程A1(旧版)：模拟含有非标准残基的溶剂化蛋白(简单版本)
2018-01-28 AMBER高级教程A3：MM-PBSA
2018-01-17 AMBER基础教程B0：AMBER分子动力学模拟入门
2018-01-07 Amber基础教程B5：模拟绿色荧光蛋白及构建修饰的氨基酸残基
2018-01-03 Amber基础教程B4：使用antechamber和GAFF模拟药物分子
2017-12-28 Windows下AmberTools17的编译
2017-12-26 Amber 2017 参考手册第一部分介绍和安装
2017-12-26 AMBER资料整理
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2014-06-10 GNU Parallel
2014-04-03 正则表达式基础知识
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2014-03-21 Bash脚本中使用颜色
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2014-01-30 命令行参数的手动处理
2014-01-23 bash命名管道
2014-01-19 Bash游戏编程：俄罗斯方块
2013-12-14 Bash脚本实现批量作业并行化
2009-01-01 Linux Bash AWK知识汇集
blender²
2024-04-03 使用Blender渲染分子模型动画
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cmd¹
2014-12-26 Windows下的命令别名工具doskey
fortran⁷
2024-04-08 trr轨迹转换程序trr2all
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2014-08-15 Fortran可变输出格式
2012-07-26 【转】Fortran的奇淫技巧
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2012-07-24 二维三次卷积插值算法及Fortran代码
gamess¹
2014-02-23 GAMESS2013编译使用简记
gmx¹¹⁷
9999-12-31 GROMACS中文手册
9999-12-01 GROMACS程序文档
9999-11-01 GROMACS程序编译
9999-10-31 GROMACS中文教程
9999-10-01 GROMACS文件类型
9999-08-01 Martini粗粒化力场使用手册
9998-01-02 GROMACS培训
9998-01-01 分子模拟之道公益讲座
2024-04-08 trr轨迹转换程序trr2all
2024-01-14 dssp数据绘图脚本dssp2gp
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2022-12-16 gmx_ir脚本更新：精简临时文件提升速度
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2021-11-26 gmx_mmpbsa脚本更新：清理整理输出
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2018-10-25 GROMACS输入文件模板
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2016-10-11 Martini实例教程：蛋白质
2016-10-10 Martini实例教程：新分子的参数化
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2016-09-28 Martini粗粒化力场使用手册：4　实例教程
2016-09-19 GROMACS如何做之膜模拟
2016-08-31 Martini粗粒化力场使用手册：1　Martini简介
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2016-06-29 GROMACS电场的使用
2016-05-31 GROMACS轨迹周期性边界条件的处理
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2016-03-11 GROMACS分析教程：使用g_select计算平均滞留时间
2015-12-13 TPPMKTOP：OPLS-AA全原子力场的GROMACS拓扑文件生成器
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2015-12-08 使用AmberTools+ACPYPE+Gaussian创建小分子GAFF力场的拓扑文件
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2015-10-12 GROMACS质心牵引的几点说明
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2014-09-24 GROMACS表面张力单位,计算及其长程校正
gnuplot³⁰
2024-10-30 失败的势能面图形复刻
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2023-08-16 使用gnuplot绘制散点密度图
2023-07-22 gnuplot绘图的坐标系统
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2022-05-23 使用gnuplot绘制氢键数据的平行轴图
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2022-05-20 颜色空间与颜色混合
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2021-12-23 使用gnuplot绘制地图
2021-12-18 类似gnuplot的在线绘图工具
2021-11-06 gmx_puckering使用示例
2021-09-10 谷歌的turbo颜色映射方案
2021-06-26 使用gnuplot评估蛋白二级结构
2021-05-26 gnuplot：绘制热度图上的等高线
2021-04-21 gnuplot：绘制蛋白拉氏图
2021-04-10 gnuplot：科技期刊调色板, 高级热图
2020-08-23 使用gnuplot绘制xpm文件对应的数据
2019-02-08 gnuplot分段拟合颜色映射表达式
2018-09-27 gnuplot显示优化过程
2018-08-20 科技绘图的调色板
2018-06-25 gnuplot绘制RMSD的统计直方图
2018-04-02 gnuplot伪三维瀑布图
2015-01-18 gnuplot动画
2015-01-09 gnuplot拟合参数的误差及相关系数
2015-01-04 gnuplot作图时插入LaTex公式
2014-04-06 gnuplot颜色设置
2014-02-23 图片与文本共舞：gnuplot的svg终端
2014-02-21 gnuplot直接数据作图
2012-11-17 GnuPlot：简单数据统计处理及取整函数int/floor的问题
html³
2015-08-03 网页特效：回到顶部, 目录跟随定位, 翻书效果
2014-07-03 UTF-8符号
2012-07-21 科学网博客HTML代码发布不完全解决方案
jmol²
2014-07-01 Jmol的扩展xyz文件格式
2013-06-24 Jmol的select命令
js²⁷
2022-04-15 力场拟合工具xff开发杂记
2021-09-30 副本交换动力学T-REMD模拟的温度分布计算器
2020-04-05 氧化石墨烯的结构与建模
2019-11-19 在线计算兼单位换算器
2018-09-16 模拟命令行操作的svg动画
2018-01-25 分子中原子编号的匹配
2017-12-09 GMXTOP：集成MKTOP的原子类型判定代码
2017-03-02 弱酸和配合物分布曲线绘制工具
2016-11-07 单位换算器
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2016-06-02 使用GitHub的issue存储数据
2015-07-15 绘制反应机理势能面的小工具
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2015-06-11 KineticJS教程7：舞台
2015-06-11 KineticJS教程6：对象的移动及其上下层关系
2015-06-11 KineticJS教程5：选择器
2015-06-11 KineticJS教程4：图形变换与动画
2015-06-11 KineticJS教程3：事件响应与拖曳
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2016-02-15 博客改版简记
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2014-12-25 让Markdown支持ASCII流程图和JavaScript流程图
2014-08-15 markdown在计算化学领域的扩展应用
2014-07-02 markdown幻灯片
2014-06-04 你好, 世界
2014-04-01 Javascript版本的Markdown
2014-02-02 转战Markdown
martini¹⁰
9999-08-01 Martini粗粒化力场使用手册
2019-08-05 吴伟：auto-martini的安装和使用简介
2016-12-30 Martini实例教程：聚合物
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2016-10-10 Martini实例教程：新分子的参数化
2016-09-30 Martini实例教程：使用VMD可视化Martini体系
2016-09-28 Martini粗粒化力场使用手册：4　实例教程
2016-08-31 Martini粗粒化力场使用手册：1　Martini简介
2016-08-31 Martini粗粒化力场使用手册：2　常见问题
mathjax³
2015-01-04 gnuplot作图时插入LaTex公式
2014-12-11 物理化学中的标准态符号
2014-04-19 希腊字母与拉丁字母的对应
matlab¹²
2018-07-19 MSD算扩散系数的几种方法
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2017-05-05 随机抽样一致性算法matlab示例代码
2016-08-09 太阳能电池效率的计算
2016-06-20 Matlab插值曲面及其曲率的计算
2015-05-08 MatLab中英文字体设置
2014-10-03 剪切模量各向异性
2014-09-07 三维光谱数据绘图
2014-04-17 材料弹性模量各向异性的三维图示方法
2013-11-09 飞秒泵浦-探测实验动力学数据处理
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2013-08-22 电导弛豫法测材料的氧表面交换系数和体相扩散系数
md¹⁰
2016-08-05 Packmol程序资料整理
2016-03-31 使用GROMACS和VMD绘制空间分布函数SDF的步骤
2016-02-21 构建表面修饰长链分子的纳米颗粒模型
2015-12-06 Windows下的AmberTools+RESP+ACPYPE
2015-11-20 统计蛋白质空腔或通道内的水分子数目
2014-09-24 GROMACS表面张力单位,计算及其长程校正
2014-09-23 液滴接触角的计算
2014-05-13 空间分布函数SDF的计算及三维图示
2014-05-09 石墨烯：建模, 几何性质及力场模拟
2013-12-01 常见冰的晶体结构及其cif文件
origin⁶
2018-08-06 origin自动载入xvg数据作图
2017-02-23 OriginPro 2017中文版
2016-10-05 使用bash编辑二进制文件：创建Origin调色板文件
2015-02-22 Origin7.5SR7中文版
2015-01-09 gnuplot拟合参数的误差及相关系数
2014-03-19 Origin相关
pdb¹
2015-06-05 PDB文件格式说明
povray¹
2016-01-10 单层螺线管周围的磁场
pqs¹
2014-06-12 NICS计算及其图示
pymol⁵
2020-04-20 开源版和试用版pymol的安装
2019-09-18 PyMOL绘制坐标轴以及盒子
2017-12-14 计算蛋白自由能形貌图的简单示例
2015-12-01 PyMOL的体数据渲染
2013-04-18 利用PyMOL制作反应势能面示意动画
python²
2017-12-06 曲线的变形
2013-04-18 利用PyMOL制作反应势能面示意动画
tcl³
2022-08-20 VMD的图形矩阵及其应用
2017-01-11 我使用的VMD初始化脚本
2016-10-28 TCL培训教程
vasp³
2017-09-26 新版VASP轨迹文件转换为GROMACS格式
2014-05-21 VASP使用
2014-05-19 VASP.5.2.12编译：Intel Fortran+MPI+MKL
vmd¹⁵
2022-08-20 VMD的图形矩阵及其应用
2021-06-13 VMD氢键插件及其应用
2020-09-08 VMD渲染相关的几个问题
2020-08-31 Win7-x64版本的VMD
2020-03-25 VMD建模示例
2020-03-23 VMD的向量与矩阵操作
2019-01-29 VMD的RMSD计算器简单使用
2017-02-11 自动调整VMD窗口的位置和大小
2017-01-11 我使用的VMD初始化脚本
2017-01-09 GROMACS分析教程：氢键分析
2016-12-31 GROMACS和VMD中的氢键判定标准
2016-10-28 TCL培训教程
2016-10-21 VMD加载GROMACS轨迹的速度信息与时间信息
2016-05-31 GROMACS轨迹周期性边界条件的处理
2016-03-31 使用GROMACS和VMD绘制空间分布函数SDF的步骤
webgl¹
2018-03-16 canvas二维光照效果
办公¹
2015-06-24 Office和EndNote的小技巧
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